研究者强烈建议基因测试实验室定期重新审查他们的记录，并在科学发展导致基因被重新分类时提醒医生。
“个性化医疗”或称“精准医疗”的一个重要特点就是根据每个患者的自身特点和个体病情进行医护，其中患者的遗传特征占据非常重要的地位。检测与遗传性癌症风险相关的基因，可以在医疗管理中发挥重要作用。随着基因测序的成本越来越低，其应用也越来越普及。但基因检测结果并不是一成不变的，对于结果的解读仍然是个挑战。
本文来源：康健新视野
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近日，来自美国德州大学西南医学中心（UT Southwestern Medical Center）的一项新研究结果显示，当回顾来自上百万个体的基因检测结果时，发现有近25％的“意义不明”的基因突变被重新分类，与癌症的相关性出现了变化。因此，研究者强烈建议基因测试实验室定期重新审查他们的记录，并在科学发展导致基因被重新分类时提醒医生。研究发表在《美国医学会杂志》（JAMA）上。
人类大约有20,000个基因，其中尚有不少基因的功能和意义未明。典型的基因含有约27,000个碱基对（A-T，G-C），一些基因可以高达200万个碱基对。当碱基对出现变异时可能会影响其编码的蛋白质，有些变化会对癌症风险造成影响。基因中的大量碱基对意味着存在大量的潜在变异——与标准不同的序列——的可能性。因为大多数变异对人类健康几乎没有实际或者可观察到的影响，这些变异必须被仔细评估，以确定其致病性。
2015年颁布的标准要求考虑几种不同类型的证据，包括临床观察、家庭隔离、人口流行度以及计算和功能数据，但大多数变异的证据有限，关于致病性还是良性的结果常常是不确定、尚处于发展中的。一些之前并不了解的变异，随着科学进展其意义可能会被阐明，因此对于基因测序结果也值得一再结合新进展来解读。
当在基因中发现变异时，它们被分类为“良性”、“可能是良性”、“意义不明”、 “可能致病性”或“致病性”。良性和致病性突变按定义为超过90％可能性。随着时间的推移，基因变异可能会被重新分类，例如，从“意义不明”的变异转化为“可能致病性”的变异，反之亦然。随着科学发展，新的数据一直在涌现。
研究者可能会发现对癌症易感的基因家族，并从其DNA中学到新东西。实验室可以通过基因变异推定蛋白质的结构并检查是否有异常的形状，或观察具有变异基因的细胞表现良好还是不佳。如果家族、生化和功能数据均指向异常，那么这个基因变异会从“意义不明”的分类移至“致病性”。
在这项回顾性队列研究中，研究者回顾了Myriad Genetics这个基因测序实验室在10年间对癌症基因的检测结果以及来自UT西南大学癌症遗传学计划的相关临床数据，包括了145万名被测试者和167万份初始测试报告。
由于变异被重新分类，研究者一共发现了59,955份修订报告。在最初被归类为“意义不明”的变体中，7.7％被重新分类，其中91.2％被降级为不太严重的分类（良性，可能良性），8.7％被升级为更严重的分类（致病性，可能致病性）。但最初被归类为致病性或良性的变异则很少有被重新分类的。
“如果一个变异被重新归类为致病性变异，那么它对患者很重要，”该研究的高级作者，UT西南大学Harold C. Simmons综合癌症中心内科医学教授Theo Ross博士说：“比如说，如果患者具有缺陷的Lynch综合征基因，那么他们需要个性化的医疗手段，例如在较早的年龄或更频繁地进行结肠镜检查，有时甚至每年一次。又比如说，如果患者具有缺陷的BRCA基因，他们可能希望进行预防性乳腺移除手术，或在其乳房X光筛查计划中增加MRI扫描项目。”
即使是从“意义不明”到“良性”的重新分类对患者来说也很重要，可以让他们安心。这次的结果就显示，重新分类的“意义不明”突变中，绝大多数（超过90%）都是良性或者可能良性的，这对于患者而言是能改善心理状态甚至生活质量的信息。
“这项研究的意义是三管齐下的。医生需要了解基因变异的知识发展得多快，变异被重新分类是很常见的。实验室需要定期检查基因变异信息并提醒医生改变。最后，患者及其家属需要从医生处了解变异的重新分类，以便做出明智的选择，” Ross博士说。
参考资料
1. Genetic testing: Not a one-and-done deal, retrieved 2018/09/28, https://www.eurekalert.org/pub_releases/2018-09/usmc-gtn092518.php
2. Jacqueline Mersch et al., JAMA, 2018, doi:10.1001/jama.2018.13152
